Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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