Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ThpoP40226 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms