Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms