Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms