Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms