Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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