Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

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Length 298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
NapbP28663 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NapbP28663 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NapbP28663 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NapbP28663 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NapbP28663 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NapbP28663 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NapbP28663 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NapbP28663 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NapbP28663 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms