Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
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PdgfraP26618 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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PdgfraP26618 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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PdgfraP26618 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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