Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CftrP26361 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CftrP26361 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CftrP26361 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CftrP26361 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CftrP26361 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CftrP26361 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CftrP26361 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CftrP26361 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CftrP26361 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CftrP26361 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CftrP26361 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CftrP26361 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CftrP26361 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CftrP26361 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CftrP26361 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CftrP26361 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CftrP26361 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CftrP26361 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CftrP26361 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CftrP26361 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CftrP26361 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CftrP26361 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CftrP26361 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CftrP26361 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CftrP26361 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CftrP26361 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CftrP26361 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CftrP26361 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CftrP26361 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CftrP26361 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CftrP26361 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CftrP26361 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CftrP26361 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CftrP26361 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CftrP26361 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CftrP26361 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CftrP26361 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CftrP26361 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CftrP26361 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CftrP26361 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CftrP26361 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CftrP26361 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CftrP26361 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CftrP26361 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CftrP26361 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CftrP26361 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CftrP26361 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CftrP26361 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CftrP26361 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CftrP26361 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CftrP26361 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CftrP26361 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CftrP26361 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CftrP26361 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CftrP26361 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CftrP26361 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CftrP26361 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CftrP26361 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CftrP26361 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CftrP26361 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CftrP26361 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CftrP26361 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms