Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChgaP26339 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms