Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PparaP23204 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms