Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3P21107 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms