Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb9P20615 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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