Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P20040 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
P20040 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms