Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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