Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnnc1P19123 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms