Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms