Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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