Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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PcnaP17918 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PcnaP17918 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PcnaP17918 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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