Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms