Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms