Protein–RNA interactions for Protein: P0C7N9

Psmg4, Proteasome assembly chaperone 4, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg4P0C7N9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Psmg4P0C7N9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms