Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms