Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BlmO88700 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BlmO88700 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BlmO88700 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BlmO88700 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BlmO88700 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BlmO88700 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BlmO88700 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BlmO88700 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BlmO88700 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BlmO88700 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BlmO88700 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BlmO88700 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BlmO88700 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BlmO88700 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BlmO88700 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BlmO88700 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BlmO88700 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BlmO88700 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BlmO88700 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BlmO88700 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BlmO88700 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BlmO88700 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BlmO88700 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BlmO88700 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BlmO88700 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BlmO88700 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BlmO88700 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BlmO88700 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BlmO88700 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BlmO88700 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BlmO88700 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BlmO88700 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BlmO88700 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BlmO88700 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BlmO88700 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BlmO88700 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BlmO88700 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BlmO88700 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BlmO88700 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BlmO88700 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BlmO88700 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BlmO88700 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BlmO88700 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BlmO88700 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BlmO88700 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BlmO88700 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BlmO88700 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BlmO88700 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BlmO88700 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BlmO88700 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BlmO88700 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BlmO88700 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BlmO88700 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BlmO88700 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BlmO88700 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BlmO88700 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BlmO88700 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BlmO88700 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BlmO88700 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BlmO88700 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BlmO88700 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BlmO88700 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BlmO88700 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BlmO88700 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BlmO88700 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BlmO88700 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BlmO88700 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BlmO88700 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BlmO88700 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BlmO88700 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms