Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stra6O70491 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stra6O70491 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms