Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms