Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Foxq1O70220 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms