Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Copb2O55029 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms