Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrxO54751 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms