Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms