Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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