Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms