Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag2O35638 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms