Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Clk2O35491 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Clk2O35491 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Clk2O35491 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms