Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Dgcr6O35347 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Dgcr6O35347 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Dgcr6O35347 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Dgcr6O35347 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Dgcr6O35347 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Dgcr6O35347 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Dgcr6O35347 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Dgcr6O35347 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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