Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NmiO35309 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmiO35309 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmiO35309 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmiO35309 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmiO35309 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmiO35309 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NmiO35309 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmiO35309 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmiO35309 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmiO35309 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmiO35309 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmiO35309 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmiO35309 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmiO35309 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmiO35309 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NmiO35309 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmiO35309 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmiO35309 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmiO35309 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmiO35309 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NmiO35309 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmiO35309 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NmiO35309 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NmiO35309 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmiO35309 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmiO35309 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmiO35309 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmiO35309 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmiO35309 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmiO35309 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmiO35309 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmiO35309 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmiO35309 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmiO35309 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmiO35309 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmiO35309 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmiO35309 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NmiO35309 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NmiO35309 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NmiO35309 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NmiO35309 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NmiO35309 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NmiO35309 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NmiO35309 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NmiO35309 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NmiO35309 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NmiO35309 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NmiO35309 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms