Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ArxO35085 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ArxO35085 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ArxO35085 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ArxO35085 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ArxO35085 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ArxO35085 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ArxO35085 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ArxO35085 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ArxO35085 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ArxO35085 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ArxO35085 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ArxO35085 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ArxO35085 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ArxO35085 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ArxO35085 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ArxO35085 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ArxO35085 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ArxO35085 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ArxO35085 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ArxO35085 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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