Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gcm2O09102 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms