Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MttpO08601 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MttpO08601 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MttpO08601 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MttpO08601 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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MttpO08601 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MttpO08601 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MttpO08601 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MttpO08601 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MttpO08601 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MttpO08601 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MttpO08601 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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MttpO08601 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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MttpO08601 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MttpO08601 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MttpO08601 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MttpO08601 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MttpO08601 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MttpO08601 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MttpO08601 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MttpO08601 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms