Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AlyrefO08583 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AlyrefO08583 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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