Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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