Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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