Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm3278L7N2D2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gm3278L7N2D2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gm3278L7N2D2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gm3278L7N2D2 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gm3278L7N2D2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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