Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm2056J3QQ02 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms