Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms