Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm3415J3QMS8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm3415J3QMS8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm3415J3QMS8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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