Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6176J3QK59 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms