Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21897J3KMP5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21897J3KMP5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21897J3KMP5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21897J3KMP5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21897J3KMP5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21897J3KMP5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21897J3KMP5 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm21897J3KMP5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm21897J3KMP5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm21897J3KMP5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm21897J3KMP5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm21897J3KMP5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm21897J3KMP5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm21897J3KMP5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21897J3KMP5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Gm21897J3KMP5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm21897J3KMP5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm21897J3KMP5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm21897J3KMP5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm21897J3KMP5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm21897J3KMP5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm21897J3KMP5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm21897J3KMP5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm21897J3KMP5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm21897J3KMP5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21897J3KMP5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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