Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms