Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Taf4bG5E8Z2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Taf4bG5E8Z2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Taf4bG5E8Z2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Taf4bG5E8Z2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Taf4bG5E8Z2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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